Linia duchów w Afryce wniosła 1,5 mld zasad do ludzkiego DNA

Nieznana wcześniej archaiczna linia ludzka wniosła DNA do współczesnych ludzi, według badania opublikowanego 31 lipca 2026 r. Naukowcy z Uniwersytetu Kalifornijskiego w Berkeley zidentyfikowali segmenty genetyczne pochodzące z "linii duchów", która krzyżowała się z przodkami wszystkich obecnych populacji przed ekspansją z Afryki.

Odkrycie dotyczy wszystkich współczesnych ludzi, ponieważ DNA linii duchów występuje w każdej badanej populacji. Populacje afrykańskie noszą bardziej zróżnicowane i odrębne segmenty, podczas gdy grupy pozaafrykańskie wykazują około 100 regionów genomu całkowicie pozbawionych tego archaicznego pochodzenia. Wnioski pochodzą z analizy około 500 genomów współczesnych ludzi.

Praca jest istotna, ponieważ ujawnia trzecie główne wydarzenie krzyżowania się w historii ludzkości, poza tymi z neandertalczykami i denisowianami. Linia duchów oddzieliła się od współczesnych ludzi ponad 800 tys. lat temu, mniej więcej w tym samym czasie, co przodek neandertalczyków i denisowian. Jej DNA stanowi od 0,5 do 1,1 procent obecnych genomów, obejmując prawie 1,5 miliarda zasad.

Zespół z Berkeley opracował narzędzie programowe o nazwie TRACE do wykrywania sekwencji introresyjnych, szukając DNA, które jest zarówno stare pod względem wspólnego pochodzenia, jak i młode pod względem historii rekombinacji. TRACE najpierw z powodzeniem zidentyfikował znane segmenty neandertalskie i denisowiańskie z dokładnością ponad 90 procent i współczynnikiem fałszywych odkryć poniżej 0,25 procent. Zastosowany do genomów afrykańskich wykazał tylko 0,1 procent pochodzenia neandertalskiego lub denisowiańskiego, co jest zgodne z jego niskim poziomem błędów.

Segmenty linii duchów są średnio krótsze niż neandertalskie i denisowiańskie, co wskazuje, że weszły do genomu współczesnego człowieka wcześniej. Co ciekawe, to archaiczne DNA pojawia się w genomicznych "pustyniach", gdzie brakuje DNA neandertalskiego i denisowiańskiego, co sugeruje, że coś w tych regionach było szczególnie problematyczne dla tych linii. Badanie wykryło również niewielką frakcję jeszcze starszego DNA – około 0,3 procent sekwencji denisowiańskich w genomach oceanicznych – pochodzącego z linii "superarchaicznej", która rozgałęziła się prawie 1,8 miliona lat temu.

Naukowcy zauważają, że DNA linii duchów jest mniej powszechne w pobliżu genów, ale pobliskie geny często są zaangażowane w metabolizm i funkcje odpornościowe. Nadal nie jest jasne, czy te starożytne warianty są adaptacyjne. Zespół ma nadzieję, że przyszłe odkrycia starożytnego DNA lub archeologiczne mogą ujawnić więcej na temat tej tajemniczej populacji.