Призрачная линия в Африке внесла 1,5 млрд оснований в ДНК человека

Ранее неизвестная архаичная линия людей внесла свой вклад в ДНК современных людей, согласно исследованию, опубликованному 31 июля 2026 года. Исследователи из Калифорнийского университета в Беркли идентифицировали генетические сегменты от «призрачной линии», которая скрещивалась с предками всех современных популяций до исхода из Африки.

Это открытие затрагивает всех современных людей, поскольку ДНК призрачной линии присутствует во всех протестированных популяциях. Африканские популяции несут более разнообразные и отличительные сегменты, тогда как у неафриканских групп около 100 геномных областей полностью лишены этой архаичной примеси. Выводы основаны на анализе примерно 500 геномов современных людей.

Эта работа важна, поскольку она выявляет третье крупное событие скрещивания в истории человечества, помимо скрещивания с неандертальцами и денисовцами. Призрачная линия отделилась от современных людей более 800 000 лет назад, примерно в то же время, когда разошлись предки неандертальцев и денисовцев. Её ДНК составляет от 0,5 до 1,1 процента современных геномов, охватывая почти 1,5 миллиарда оснований.

Команда из Беркли разработала программный инструмент под названием TRACE для обнаружения интрогрессированных последовательностей, выявляя ДНК, которая выглядит одновременно древней по общему происхождению и молодой по истории рекомбинации. TRACE сначала успешно идентифицировал известные сегменты неандертальцев и денисовцев с точностью более 90 процентов и частотой ложных обнаружений ниже 0,25 процента. При применении к африканским геномам он обнаружил лишь 0,1 процента неандертальской или денисовской примеси, что согласуется с низкой частотой ошибок.

Сегменты призрачной линии в среднем короче, чем у неандертальцев и денисовцев, что указывает на то, что они попали в геном современных людей раньше. Интересно, что эта архаичная ДНК появляется в геномных «пустынях», где отсутствует ДНК неандертальцев и денисовцев, что предполагает наличие чего-то специфически проблемного в этих линиях в данных областях. Исследование также выявило крошечную долю ещё более древней ДНК — около 0,3 процента денисовских последовательностей в геномах океанийцев — от «суперархаичной» линии, ответвившейся почти 1,8 миллиона лет назад.

Исследователи отмечают, что ДНК призрачной линии реже встречается вблизи генов, но соседние гены часто участвуют в метаболизме и иммунной функции. Остаётся неясным, являются ли эти древние варианты адаптивными. Команда надеется, что будущие открытия древней ДНК или археологические находки могут пролить свет на эту загадочную популяцию.