La modélisation des contacts basée sur AlphaFold3 permet un édition précise des bases d'ADN

Des chercheurs ont développé une nouvelle méthode pour l'édition précise des bases d'ADN en intégrant la modélisation des contacts basée sur AlphaFold3, selon une étude publiée dans Nature. L'approche permet un ciblage plus précis des changements de nucléotides uniques dans le génome, ce qui pourrait améliorer la thérapie génique et la recherche génétique.

La technique affecte les scientifiques et cliniciens travaillant sur l'édition du génome, en particulier ceux qui utilisent des éditeurs de bases pour corriger les mutations responsables de maladies. En prédisant plus fiablement les interactions protéine-ADN, la méthode réduit les modifications hors cible, rendant les traitements plus sûrs et plus efficaces.

Cela est important car les outils d'édition de bases actuels peuvent modifier par inadvertance des sites d'ADN non ciblés, limitant leur potentiel thérapeutique. La nouvelle approche de modélisation améliore la précision, accélérant potentiellement le développement de thérapies géniques pour les troubles génétiques.

L'étude, publiée le 12 février 2025, a impliqué des chercheurs de plusieurs institutions. Ils ont utilisé AlphaFold3 pour modéliser la structure des protéines d'édition de bases liées à l'ADN, prédisant les points de contact qui déterminent la précision de l'édition. La méthode a atteint un taux de succès de 90 % dans le ciblage de bases spécifiques dans des cellules humaines, contre 70 % avec la conception conventionnelle.

Les travaux antérieurs sur l'édition de bases, rapportés pour la première fois en 2016, ont rencontré des défis liés aux effets hors cible. Cette nouvelle étape de modélisation s'appuie sur les prédictions de structure protéique d'AlphaFold, qui ont remporté le prix Nobel de chimie 2024.

Les prochaines étapes comprennent des tests de la méthode sur des modèles animaux et éventuellement dans des essais cliniques humains. Les chercheurs prévoient également d'adapter l'approche pour d'autres outils d'édition du génome, tels que les éditeurs primaires, afin d'élargir ses applications.