基于AlphaFold3的接触建模实现精确DNA碱基编辑

研究人员开发了一种通过整合基于AlphaFold3的接触建模来实现精确DNA碱基编辑的新方法，根据发表在《自然》杂志上的一项研究。该方法能够更准确地靶向基因组中的单核苷酸变化，这可能改善基因治疗和基因研究。

该技术影响从事基因组编辑的科学家和临床医生，特别是那些使用碱基编辑器纠正致病突变的人。通过更可靠地预测蛋白质-DNA相互作用，该方法减少了脱靶编辑，使治疗更安全、更有效。

这之所以重要，是因为当前的碱基编辑工具可能会无意中修改非目标DNA位点，限制了它们的治疗潜力。新的建模方法提高了精确度，可能加速遗传疾病基因疗法的开发。

该研究于2025年2月12日发表，涉及多个机构的研究人员。他们使用AlphaFold3对碱基编辑器蛋白与DNA结合的结构进行建模，预测决定编辑准确性的接触点。该方法在人类细胞中靶向特定碱基的成功率达到90%，而传统设计仅为70%。

早期关于碱基编辑的工作（首次报道于2016年）一直面临脱靶效应的挑战。这一新的建模步骤建立在AlphaFold的蛋白质结构预测之上，后者获得了2024年诺贝尔化学奖。

下一步包括在动物模型中测试该方法，并最终进行人体临床试验。研究人员还计划将该方法适配到其他基因组编辑工具（如先导编辑器）上，以扩展其应用。