El modelado de contactos basado en AlphaFold3 permite la edición precisa de bases de ADN

Investigadores han desarrollado un nuevo método para la edición precisa de bases de ADN integrando el modelado de contactos basado en AlphaFold3, según un estudio publicado en Nature. El enfoque permite una orientación más precisa de cambios de un solo nucleótido en el genoma, lo que podría mejorar la terapia génica y la investigación genética.

La técnica afecta a científicos y clínicos que trabajan en edición del genoma, particularmente aquellos que utilizan editores de bases para corregir mutaciones causantes de enfermedades. Al predecir las interacciones proteína-ADN de manera más fiable, el método reduce las ediciones fuera del objetivo, haciendo los tratamientos más seguros y efectivos.

Esto es importante porque las herramientas actuales de edición de bases pueden modificar inadvertidamente sitios de ADN no deseados, limitando su potencial terapéutico. El nuevo enfoque de modelado mejora la precisión, acelerando potencialmente el desarrollo de terapias génicas para trastornos genéticos.

El estudio, publicado el 12 de febrero de 2025, involucró a investigadores de múltiples instituciones. Utilizaron AlphaFold3 para modelar la estructura de las proteínas editoras de bases unidas al ADN, prediciendo puntos de contacto que determinan la precisión de la edición. El método logró una tasa de éxito del 90% en la orientación de bases específicas en células humanas, en comparación con el 70% con el diseño convencional.

Trabajos anteriores sobre edición de bases, reportados por primera vez en 2016, han enfrentado desafíos con efectos fuera del objetivo. Este nuevo paso de modelado se basa en las predicciones de estructura de proteínas de AlphaFold, que ganaron el Premio Nobel de Química en 2024.

Los próximos pasos incluyen probar el método en modelos animales y eventualmente en ensayos clínicos en humanos. Los investigadores también planean adaptar el enfoque para otras herramientas de edición del genoma, como los editores prime, para expandir sus aplicaciones.