ИИ из Стэнфорда создал вирусы с 50+ изменениями аминокислот

6 августа 2026 года исследователи из Стэнфордского университета сообщили, что с помощью больших моделей генома они сконструировали 16 синтетических вирусов, подавляющих рост кишечной палочки. Модели Evo 1 и Evo 2 были обучены на ДНК бактериофагов и доработаны на семействе Microviridae, к которому относится тестовый вирус ΦX174. На основе коротких последовательностей из начала генома ΦX174 модели сгенерировали 302 предполагаемые последовательности. После отсева вариантов с поврежденными жизненно важными генами, экстремальной длиной или необычным составом оснований команда химически синтезировала 285 последовательностей и вставила их в бактерии. Шестнадцать из них подавили рост бактерий.

Большинство жизнеспособных вирусов напоминали ΦX174, причем жизнеспособность возрастала до 46 процентов среди тех, чья последовательность совпадала как минимум на 98 процентов. Однако отдельные вирусы имели заметные отличия: один полностью потерял вирусный белок, другой приобрел новый ген, а третий заменил ген последовательностью от отдаленно родственного вируса. Изменения, внесенные ИИ, сохраняли функцию гораздо чаще, чем случайные мутации. Почти четверть вирусов с более чем 25 изменениями аминокислот оставались жизнеспособными, тогда как случайные изменения почти наверняка инактивировали бы их.

Коктейль из 16 созданных ИИ вирусов быстро эволюционировал, чтобы заражать штаммы кишечной палочки, устойчивые к природным бактериофагам, возможно, за счет обмена ДНК и новых мутаций. Это указывает на потенциальное применение в фаговой терапии. Исследователи исключили из обучающих данных вирусы, поражающие позвоночных, но предупреждают, что любой, обладающий достаточными вычислительными ресурсами, может повторить эту работу с такими вирусами. В статье содержится призыв к улучшению регулирования больших моделей генома и синтеза кастомной ДНК, отмечая, что регулирование ИИ в значительной степени не поспевает за стремительным развитием этой области.