Claude 30+ biyoloji modelini 4 kat hızlandırdı, yarışma açıldı

Anthropic, 17 Eylül 2026'da yayımladığı araştırmada, şirket içi genel amaçlı bir Claude araştırma modelinin yapısal biyologların her gün çalıştırdığı yazılımı yeniden yazdığını anlattı. Şirkete göre Claude, dört haftadan kısa bir sürede yapı tahmini, protein tasarımı, genomik ve protein dil modellerini kapsayan 30'dan fazla açık kaynaklı biyomoleküler derin öğrenme modeli için 36 optimize edilmiş paket üretti.

Rakamlar Anthropic'in kendi teknik raporundan geliyor. Bir miktar sayısal hassasiyeti hızla takas eden "Fast" modu, 13 yapı tahmini modelinin ileri geçişini NVIDIA H100 GPU'larda ortalama 4,1 kat hızlandırdı. Değiştirilmemiş modelin çıktısını bit düzeyinde birebir üreten "Exact" modu ise 14 modelde ortalama 1,6 kat hız kazandırdı. Model başına kazanç OpenDDE'de 2,3 kat, Chai-1'de 6,4 kata kadar çıkıyor. Optimize edilmiş kod aynı gün GitHub'da, Apache 2.0 lisansıyla 36 hazır kit olarak yayımlandı; depo bunun bakımı yapılmayacak bir referans sürümü olduğunu belirtiyor.

İşin merkezinde FlashPairformer var: AlphaFold3 sınıfı modellerde çalışma süresinin çoğunu yiyen ve maliyeti sistem büyüklüğüyle kübik artan triangle attention ile triangle multiplication işlemleri için yazılmış özel GPU çekirdekleri. Anthropic, tek bir H100 üzerinde ölçülen testlerde FlashPairformer'ın sektör standardı çekirdekleri triangle attention'da 2,7 ve 2,9 kat, triangle multiplication'da 1,7 ve 3,2 kat geride bıraktığını bildiriyor. Şirkete göre çalışmayı ağırlıklı olarak, biyomoleküler modellemeyi bilen ama çıkarım optimizasyonu ya da çekirdek mühendisliği deneyimi olmayan iki teknik personel denetledi.

Pratik kazanç, düşük bellekli "Big" modu: tek bir NVIDIA GPU düğümü artık 10.000 token'dan büyük sistemleri katlayabiliyor. İnsan mitokondriyal kompleks I, bakteriyel 70S ribozomu, TRiC şaperon kompleksi ve bir proteazom bu modda deneysel olarak belirlenmiş yapılarına çok yakın biçimde tahmin edildi. Karşılaştırma için: AlphaFold3'ün doğru tahmin ettiği 40S ribozomu 7.663 token'dı. Anthropic ayrıca, daha önce hedef başına 10.000 dolara kadar harcadığı bağlayıcı protein tasarım kampanyasının silico ortamdaki puanlarını, tek bir H200 üzerinde 24 saat çalışan tek bir Claude modeliyle ve yaklaşık 150 dolarlık toplam GPU ve token harcamasıyla yakaladığını söylüyor.

Yayın kendi sınırlarını da yazıyor: sekiz GPU'lu tek bir B300 düğümünde 31.000 ila 70.000 token'lık viral kapsitlere ve protein bölmelerine zorlandığında tahminler çöküyor. Silico puanları da laboratuvar kanıtı değil; Adaptyv Bio ile ortaklaşa düzenlenen yarışmanın amacı tam olarak bunu sağlamak. İki kuruluş, topluluktan gelen 5.000'den fazla tasarımın Adaptyv'in otomatik laboratuvarında katılımcılara ücretsiz olarak sentezlenip test edilmesi için 1 milyon dolarlık deneysel doğrulamayı birlikte finanse ediyor; Anthropic buna 1 milyon dolara kadar Claude kredisi, Modal 250.000 dolara kadar hesaplama kredisi, Twist Bioscience ise DNA ekliyor. Nakit ödül yok. Türler arası çapraz reaktivite, pH duyarlılığı, peptit-MHC özgüllüğü ve GPCR hedefleri gibi beş zorluk 28 Eylül-31 Ekim arasında haftada bir açılacak; başvurular 24 Eylül'de kapanıyor, doğrulama 30 Kasım'a kadar tamamlanacak ve başarısız tasarımlar dahil sonuçlar 15 Aralık'ta Proteinbase'de herkese açık yayımlanacak. Takvimin planlanmış olduğu ve değişebileceği belirtiliyor.

Şeffaflık notu: NewUJ'un editoryal süreci Anthropic'in Claude modellerini kullanıyor.